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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物工程制品mRNA中最大要的转录后装饰,在真核生物工程制品的病检和生理上步骤中起着至关决定性的做用。痛风认识心里障碍不是种不不可逆转的周围神经系統神经系統系統退行性问题,现阶段发展进步确凿切机能还没有基本说明,然后缺乏性高效的可以防止感染和治疗方法方法。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物学为其提供m6A甲基化介绍科技的服务,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

小文章种类:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

企业计量单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

钻研用料:小鼠脑组织

拜谱提供了技术性:m6A甲基化(MeRIP-seq)

论文摘要图:

图1| 论文摘要图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

实验报告

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因修饰语的改进

研发职工前提制定了高脂餐饮和自我认同障碍性(DCI)的小鼠3d模型。为十分较组(n = 3)和DCI组(n = 3)左右的m6A染色体绘制,研发职工适用MeRIP-seq使用了转录组范畴内的m6A-seq进行分析。在DCI组的10664个编写代码染色体转录物(mRNAs)共产党找到较组的23716个大概不叠加的m6A峰。相对比行于,DCI组表现形式出23,756个大概非叠加m6A峰。表中,934五个甲基化染色体在较组和DCI组左右叠加(图2)。

图2| 對照组和DCl组m6a遮盖dna的维恩图

共鉴定会出1276个不一样甲基化的m6A位点(DMMSs),其中的60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化技术水平各是相关系数超过比较组。分折其数据遍布情况发生发掘m6A峰数据遍布在因此RNA中(图3A),并不一样其数据遍布的转录领域氛围下五组:5'UTR、3'UTR、转录起讫位点领域场面描写、结束支付账户登录密码子场面描写、起讫支付账户登录密码子场面描写和编码查询队列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和结束支付账户登录密码子随近相关系数聚集(图3B)。为着分析一些基因遗传遗传上m6A装饰的领域,探究相关人员建立了有峰标注的领域,并检验了一些基因遗传遗传上reads的包括率。在DCI组中,m6A装饰区摇摆不定于3'UTR区(图3C)。因此mRNA内的DMMS都被分析到复染体上分析其数据遍布概述。不一样小鼠复染体的m6A装饰谱不一样。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的更改

是为了产品检验m6A淡化在DCI小鼠中的动物学的功能,探索师从一组填入择包含有DMMS的球脂肪酸识别码什么是染色体遗传遗传采取GO和KEGG进行介绍(图4A)。在GO进行介绍中,高甲基化什么是染色体遗传遗传在组织神经元的时候中 、动物的时候中 控制、促使吸附性和杂环有机会物运用中明显聚集。KEGG环路进行介绍表现,高甲基化什么是染色体遗传遗传与T组织神经元感觉移动的表现环路、小组织神经元肺腺癌和RIG-I样感觉移动的表现环路相应的(图4B)。就低甲基化什么是染色体遗传遗传,GO进行介绍表现在组织神经元的时候中 、新陈代谢的时候中 和运用的时候中 中明显聚集有机会环有机会物、运用杂环有机会物和促使吸附性(图4C)。KEGG环路进行介绍证明了低甲基化什么是染色体遗传遗传与肥厚性心肌病和Hippo移动的表现环路的关联性(图4D)。

图4| 相互影响甲基化m6A位点的信号通路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据表格的结合进行分析

然后探索者将m6A MeRIP-Seq的统计数据文件和仍然RNA-Seq的统计数据文件实行共同数据分析,察觉到163个mRNA,m6A峰和mRNA技术重要转换。41种mRNA的m6A和mRNA技术上浮,14种mRNA技术上涨。除此以外,30个人类表观遗传mRNA把你想表达方式出来上浮,m6A技术上涨,75个人类表观遗传mRNA把你想表达方式出来上涨,m6A技术上浮(图5A)。最后一个,勾勒半个个PPI网络信息来显现163个人类表观遗传商品代码的球蛋白直接的对接(图5B)。

右图6下图,GO和KEGG具体了解分为四组:(1) m6A上浮,mRNA再降;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A再降,mRNA再降;(4) 染色体m6A再降和mRNA上浮。在GO具体了解中,m6A上浮和mRNA再降的染色体在内部膜分解产生整个的的过程中 、幽香族有机化合物海洋生物提炼整个的的过程中 和RNA分解产生整个的的过程中 的房产管控中相关系数含有。KEGG具体了解表示,这样的染色体在皮脂酸分解产生、小内部膜肺腺癌、丙酸分解产生和异丙醇酸分解产生中含有。这对m6A上浮和mRNA上浮的染色体,GO具体了解表示在亚铁运用、亚胺丙氨酸脱羧酶化学活化、天冬氨酸1-脱羧酶化学活化和内部膜接入制造负房产管控中含有;KEGG具体了解表示在2型尿毒症、皮脂内部膜成分预警灯预警环路和胰岛素预警灯预警环路中含有。在GO具体了解中,m6A再降和mRNA再降的染色体在寡肽运用、谷胱甘肽运用和二硫硫化物硫化回归酶化学活化中含有,而在KEGG具体了解中,我们在柠檬片酸无限反复(TCA无限反复)、丙酸分解产生和多外来物种凋亡中含有。在GO具体了解中,m6A再降和mRNA上浮的染色体在胚胎骨肘关节要素有、核蛋白激酶化学活化重置和NADP分解产生整个的的过程中 中含有,在KEGG具体了解中,m6A再降和mRNA上浮染色体在新霉素、卡那霉素和周围神经菅养成分预警灯预警环路中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA表答的合力深入分析

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG研究分析

拜谱生物工程个人总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱怪物提供了m6A甲基化技艺安全服务,拜谱怪物可提供完善成熟的蛋白质组学、排泄组学、转录组学和多个学共同食品高技术工作,欢迎致电咨询!

关联性医学文献:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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